Dans le cadre du programme RECOLNAT, les Herbiers universitaires de Clermont-Ferrand représentent la 3e collection botanique. C’est un patrimoine scientifique considérable qui totalise plus de 430 000 parts, réunies pendant quatre siècles par plusieurs centaines de botanistes. C’est une collection internationale figurant sous le sigle "CLF" dans l’Index Herbariorum publié à New York par l’International Association for Plant Taxonomy. En particulier les collections du Massif central, d’Europe, d’Asie, d’Amérique du Nord, d’Afrique et du bassin méditerranéen sont particulièrement riches. Ces collections représentent une grande partie de la biodiversité, tous groupes confondus : Phanérogames, Ptéridophytes, Bryophytes, Lichens, chlorophytes (Charales), Bacillariophytes (Diatomées), Micromycètes parasites des plantes.
Elles revêtent un grand intérêt scientifique avec plusieurs centaines de "types nomenclaturaux", ou échantillons de référence pour les noms de plantes. Ces collections sont toujours vivantes : les herbiers généraux de plantes vasculaires et de bryophytes sont alimentés par des échantillons (plusieurs centaines chaque année) collectés sur le terrain lors de programmes de prospections, de recherches et d’expertises pour lesquelles ils représentent des collections de référence.
L’informatisation des collections botaniques au service de la culture scientifique et de la recherche. Depuis l’année 2000, un ambitieux programme de modernisation a permis l’informatisation de plus de 80 000 parts d’herbiers. Plus récemment, en 2007, a été mis en place avec l’aide de l’Europe (Lifegrid) un nouveau système de gestion de bases de données plus performant, hébergé sur le serveur du Centre de ressources informatiques inter-universitaire, avec un volet cartographique et un volet images numériques. Cette base de données est déjà liée historiquement au réseau des Herbiers de France.
Liste des collections
Spermaphytes et Cryptogames vasculaires
L’Herbier Général (environ 70.000 p.) réunissant de nombreuses collections (Audigier, Saint-Hilaire, Malvezin, Lavergne, Lavernhe, Dumas-Damon, Lavarenne…) et renfermant des plantes qui proviennent du monde entier
- L’Herbier D’Alleizette (environ 55.000 p.) France, Europe, Bassin méditerranéen, autres continents (dont anciennes colonies françaises)
- L’Herbier Lamotte (environ 40.000 p.) herbier historique ; Massif Central, France, Europe
- L’Herbier Chassagne (environ 32.000 p.) Auvergne, France, divers, genre Salix…
- L’Herbier Le Grand (environ 27.000 p.) Forez, Berry, France, Europe
- L’Herbier Billy (environ 25.000 p.) Basse-Auvergne, France et Europe Méditerranéenne, genres Hieracium, Thymus, Rosa, Rubus…
- L’Herbier Loiseau (environ 20.000 p.) Nivernais, Auvergne, fleuve Loire et rivière Allier, France et Afrique, Poaceae, genres Xanthium, Quercus…
- L’Herbier Lassimonne (environ 14.000 p.) Bourbonnais et divers, France.
- D’autres herbiers Bourdot, Du Buysson, Olivier, Loiseau, Winsgaarden … diverses plantes d’Auvergne et du Massif Central en cours de fusion dans l’Herbier Général.
- L’Herbier d’Afrique Afrique du Nord et Afrique Centrale
Cryptogames Bryophytes
- Herbiers de bryophytes réunis dans un herbier général en cours de constitution : Dumas-Damon, Tourret, D’Alleizette, Du Buysson, Sapaly, herbier de la Faculté des Sciences, nombreux échantillons récents apportés par R. Skrzypczak, R. Schumacker, M. Frain, J.-E. Loiseau, G. Thébaud & P. Goubet ;
- Différents herbiers maintenus à titre individuel et des dons récents apportés par divers bryologues et en particulier R. Skrzypczak, bryologue référent à l’IHUC de l'Herbier Husnot, auteur de la flore des "mousses et hépatiques de France"
- L’Herbier Heribaud, auteur des "muscinées d’Auvergne" ’ Herbier Moriot ’ Herbier Pierrot (25000 parts) renfermant la quasi-totalité des taxons européens
- Échantillons du Massif Central de l’Herbier de la station biologique des Hautes-Fagnes
- L’Herbier Faurel : bryophytes d’Afrique du Nord Cryptogames : lichens, champignons, Algues diatomées…
- Herbiers Lamy de la Chapelle ; lichens des monts Dore ’ Herbier de la Faculté des Sciences de Clermont-Ferrand
- L’Herbier Schlumberger ; cryptogames et lichens crustacées
- L’Herbier Bourdot
- L’Herbier de Cladonia de J.-E. Loiseau
Herbier de champignons
- L’Herbier Roumeguère (micromycètes parasites des plantes)
Herbier d’algues
- Algues marines (J.-E. Loiseau, E. Olivier)
- Algues d’eau douce Characées
- Diatomées d’Auvergne (collection Héribaud
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